يعين رئيس الهيئة بظهير شريف لمدة خمس سنوات قابلة للتجديد مرة واحدة، ويساعده في أداء مهامه ثلاثة نواب يعينهم مجلس الهيئة من بين أعضائه ويمارسون مهامهم بصفة دائمة وكامل الوقت بالهيئة، وكذا الأمين العام للهيئة المعين بظهير شريف.
يعتبر الرئيس الناطق الرسمي باسم الهيئة وممثلها القانوني إزاء الإدارة وكل هيئة عامة أو خاصة وأمام القضاء وإزاء الغير.
يتمتع الرئيس بجميع السلط والصلاحيات الضرورية لتسيير شؤون الهيئة وضمان حسن سيرها، ولهذا الغرض، يمارس الاختصاصات التالية:

يعين الأمين العام بظهير شريف من بين الشخصيات التي تتوفر على تجربة مهنية مشهود بها في مجالات القانون والتدبير الإداري والمالي. ويشرف، تحت سلطة رئيس الهيئة، على إدارة الهيئة التي يحدد تنظيمها واختصاصاتها في النظام الداخلي للهيئة.

ويتولى الأمين العام مساعدة رئيس الهيئة في الاضطلاع بمهامه. وبهذه الصفة، يسهر الأمين العام، تحت سلطة الرئيس، على حسن سير إدارة الهيئة، وتنسيق أنشطة مصالحها، ويعمل على مسك وثائقها ومستنداتها ويسهر على حفظها، كما يضطلع بمهام سكرتارية مجلس الهيئة.